За строител на храма се посочва хаджи Георги от село Косово – един от известните майстори строители в Рупчос. Строежът започнал още през 1854 г., но бил прекъснат заради Кримската война. След ново разрешение от османската власт през 1857 г. работата продължила и две години по-късно храмът бил завършен.

Около изграждането му са останали и интересни местни предания. Според едно от тях преди днешната църква на това място имало стара българска църква, а по-късно била построена джамия. Християнската памет обаче не изчезнала. Местни жени продължавали да палят свещи и да оставят обредни хлябове край мястото.

Преданието разказва, че това било забелязано от Ахмед ага Тъмрашлията. Той дошъл в селото, забил кюскията си в земята и казал: „Тук ще бъде черквата“. Така мястото за новия храм било определено.

Има и друго предание, свързано с името на храма. Разказва се, че местният човек Георги кехая сънувал Свети Архангел Михаил и Света Неделя. Архангелът забил меча си на мястото, където трябвало да бъде олтарът. Дали това е станало точно така, историята не може да каже, но такива разкази са част от паметта на родопските села и са се предавали от поколение на поколение.

Самият храм впечатлява с размерите си. Изграден е от камък и за времето си е бил сериозна и внушителна постройка. Според местни сведения при строежа помагали и българо-мохамедани от селото, които участвали с труд и носели камъни.

Материалът Храм „Св. Архангел Михаил“ в село Лилково, община Родопи, област Пловдив – Пловдивска духовна околия, Пловдивска епархия е публикуван за пръв път на Туристически пътеводител.